2024年10月1日に、特任准教授だった伏見さんが中部大学にPI准教授として栄転されました!
2024年10月1日に、当研究室で特任准教授を務めていた伏見圭司さんが、中部大学にPI准教授として栄転されました。おめでとうございます!!伏見さんは成川が静岡大学にて2014年に研究室を立ち上げた当初から学術研究員として当ラボに参画し、その後、特任助教になり、7年弱、静岡大学にて研究進展に貢献してくれました。その後、神戸大学にて特命准教授として3年強働いたのち、独立のために、より自身の志向する研究テーマに近い分野で研究に従事したいという意向のもと、今年の4月から都立大の当ラボに参画してくれていました。都立大では、半年間という短い期間の研究従事でしたが、彼の熱意に影響を受けた学生さんも多いと思います。伏見さんにとって、当ラボが最も在籍期間が長い研究室になります。そのような方が独立して研究室を主宰することになり、とても嬉しく思います。伏見さんは元々、天然物化学の分野で博士号を取得し、その後、当ラボに参画して分子生物学と生化学と光生物学の基本を学びました。当初はPCRなどの実験も実習でやった程度でしたが、技術を習得した後は、着々と実験を積み重ね、下図と文献リストのように、非常に多くの業績を出してくれました。原著論文24報、そのうち筆頭・共同筆頭が10報、総説論文2報が現在までに出版されています。今後も共著論文がいくつか出版されると思います。独立後は、博士課程で研究対象としていたキノコを再び研究対象として、当ラボで培った光生物学の研究手法を駆使し、キノコと光の関係性を読み解く研究を展開されるとのことです。伏見さんはこれまで、様々な研究領域に跨がって研究を行ってきたので、その経験を糧に、伏見さん独自の研究を展開できると信じています。伏見さん、本当におめでとうございます。これからが研究人生の第二幕のスタートだと思います。頑張ってください!!
原著論文(#: equally contribution, *: corresponding author)
1: Hoshino H, Miyake K, Fushimi K, Narikawa R*. Red/green cyanobacteriochromes acquire isomerization from phycocyanobilin to phycoviolobilin. Protein Sci. 2024 Aug;33(8):e5132.
2: Fukazawa M, Miyake K, Hoshino H, Fushimi K, Narikawa R*. Phycocyanobilin binding and specific amino acid residues near the chromophore contribute to orange light perception by the dualchrome phytochrome region. Plant Cell Physiol. 2024 Jul 10:pcae077.
3: Takeda Y, Ohtsu I, Suzuki T, Nakasone Y, Fushimi K, Ikeuchi M, Terazima M, Dohra H, Narikawa R*. Conformational change in an engineered biliverdin-binding cyanobacteriochrome during the photoconversion process. Arch Biochem Biophys. 2023 Sep 1;745:109715.
4: Suzuki T, Yoshimura M, Hoshino H, Fushimi K, Arai M, Narikawa R*. Introduction of reversible cysteine ligation ability to the biliverdin-binding cyanobacteriochrome photoreceptor. FEBS J. 2023 Oct;290(20):4999-5015.
5: Takemura H, Choi JH, Fushimi K, Narikawa R, Wu J, Kondo M, Nelson DC, Suzuki T, Ouchi H, Inai M, Hirai H, Kawagishi H. Role of hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase in the metabolism of fairy chemicals in rice. Org. Biomol. Chem. 2023 Mar 22;21(12):2556-2561.
6: Kuwasaki Y, Suzuki K, Yu G, Yamamoto S, Otabe T, Kakihara Y, Nishiwaki M, Miyake K, Fushimi K, Bekdash R, Shimizu Y, Narikawa R, Nakajima T, Yazawa M, Sato M*. A red light-responsive photoswitch for deep tissue optogenetics. Nat. Biotechnol. 2022 Nov;40(11):1672-1679.
7: Makita Y#, Suzuki S#, Fushimi K#, Shimada S#, Suehisa A, Hirata M, Kuriyama T, Kurihara Y, Hamasaki H, Okubo-Kurihara E, Yoshitake K, Watanabe T, Sakuta M, Gojobori T, Sakami T, Narikawa R, Yamaguchi H, Kawachi M, Matsui M*. Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton. Nat. Commun. 2021 Jun 16;12(1):3593.
8: Tachibana SR, Tang L, Zhu L, Takeda Y, Fushimi K, Ueda Y, Nakajima T, Kuwasaki Y, Sato M, Narikawa R, Fang C*. An engineered biliverdin-compatible cyanobacteriochrome enables a unique ultrafast reversible photoswitching pathway. Int. J. Mol. Sci. 2021 May 16;22(10):5252.
9: Fushimi K*, Narikawa R*. Unusual ring D fixation by three crucial residues promotes phycoviolobilin formation in the DXCF-type cyanobacteriochrome without the second Cys. Biochem. J. 2021 Mar 12;478(5):1043-1059.
10: Tachibana SR, Tang L, Chen C, Zhu L, Takeda Y, Fushimi K, Seevers TK, Narikawa R, Sato M, Fang C*. Transient electronic and vibrational signatures during reversible photoswitching of a cyanobacteriochrome photoreceptor. Spectrochim. Acta A Mol. Biomol. Spectrosc. 2021 Apr 5;250:119379.
11: Fushimi K#, Hoshino H#, Shinozaki-Narikawa N, Kuwasaki Y, Miyake K, Nakajima T, Sato M, Kano F, Narikawa R*. The cruciality of single amino acid replacement for the spectral tuning of biliverdin-binding cyanobacteriochromes. Int. J. Mol. Sci. 2020 Aug 30;21(17):6278.
12: Fushimi K, Matsunaga T, Narikawa R*. A photoproduct of DXCF cyanobacteriochromes without reversible Cys ligation is destabilized by rotating ring twist of the chromophore. Photochem. Photobiol. Sci. 2020 Oct 14;19(10):1289-1299.
13: Fushimi K*, Hasegawa M, Ito T, Rockwell NC, Enomoto G, Ni-Ni-Win, Lagarias JC, Ikeuchi M, Narikawa R*. Evolution-inspired design of multicolored photoswitches from a single cyanobacteriochrome scaffold. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2020 Jul 7;117(27):15573-15580.
14: Miyake K, Fushimi K, Kashimoto T, Maeda K, Ni-Ni-Win, Kimura H, Sugishima M, Ikeuchi M, Narikawa R*. Functional diversification of two bilin reductases for light perception and harvesting in unique cyanobacterium Acaryochloris marina MBIC 11017. FEBS J. 2020 Sep;287(18):4016-4031.
15: Kuwasaki Y, Miyake K, Fushimi K, Takeda Y, Ueda Y, Nakajima T, Ikeuchi M, Sato M, Narikawa R*. Protein engineering of dual-Cys cyanobacteriochrome AM1_1186g2 for biliverdin incorporation and far-red/blue reversible photoconversion. Int. J. Mol. Sci. 2019 Jun 15;20(12):2935.
16: Fushimi K, Miyazaki T, Kuwasaki Y, Nakajima T, Yamamoto T, Suzuki K, Ueda Y, Miyake K, Takeda Y, Choi JH, Kawagishi H, Park EY, Ikeuchi M, Sato M, Narikawa R*. Rational conversion of chromophore selectivity of cyanobacteriochromes to accept mammalian intrinsic biliverdin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2019 Apr 23;116(17):8301-8309.
17: Hasegawa M, Fushimi K, Miyake K, Nakajima T, Oikawa Y, Enomoto G, Sato M, Ikeuchi M, Narikawa R*. Molecular characterization of DXCF cyanobacteriochromes from the cyanobacterium Acaryochloris marina identifies a blue-light power sensor. J. Biol. Chem. 2018 Feb 2;293(5):1713-1727.
18: Fushimi K, Ikeuchi M, Narikawa R*. The expanded red/green cyanobacteriochrome lineage: An evolutionary hot spot. Photochem. Photobiol. 2017 May;93(3):903-906.
19: Fushimi K, Enomoto G, Ikeuchi M, Narikawa R*. Distinctive properties of dark reversion kinetics between two red/green-type cyanobacteriochromes and their application in the photoregulation of cAMP synthesis. Photochem. Photobiol. 2017 May;93(3):681-691.
20: Fushimi K, Rockwell NC, Enomoto G, Ni-Ni-Win, Martin SS, Gan F, Bryant DA, Ikeuchi M, Lagarias JC, Narikawa R*. Cyanobacteriochrome photoreceptors lacking the canonical Cys residue. Biochemistry 2016 Dec 20;55(50):6981-6995.
21: Fushimi K, Nakajima T, Aono Y, Yamamoto T, Ni-Ni-Win, Ikeuchi M, Sato M, Narikawa R*. Photoconversion and fluorescence properties of a red/green-type cyanobacteriochrome AM1_C0023g2 that binds not only phycocyanobilin but also biliverdin. Front. Microbiol. 2016 Apr 26;7:588.
22: Narikawa R*, Fushimi K, Ni-Ni-Win, Ikeuchi M. Red-shifted red/green-type cyanobacteriochrome AM1_1870g3 from the chlorophyll d-bearing cyanobacterium Acaryochloris marina. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2015 May 29;461(2):390-5.
23: Narikawa R*, Nakajima T, Aono Y, Fushimi K, Enomoto G, Ni-Ni-Win, Itoh S, Sato M, Ikeuchi M. A biliverdin-binding cyanobacteriochrome from the chlorophyll d-bearing cyanobacterium Acaryochloris marina. Sci. Rep. 2015 Jan 22;5:7950.
24: Narikawa R*, Enomoto G, Ni-Ni-Win, Fushimi K, Ikeuchi M. A new type of dual-Cys cyanobacteriochrome GAF domain found in cyanobacterium Acaryochloris marina, which has an unusual red/blue reversible photoconversion cycle. Biochemistry 2014 Aug 12;53(31):5051-9.
総説
1: Fushimi K, Narikawa R*. Phytochromes and cyanobacteriochromes: Photoreceptor molecules incorporating a linear tetrapyrrole chromophore. Adv. Exp. Med. Biol. 2021;1293:167-187.
2: Fushimi K, Narikawa R*. Cyanobacteriochromes: photoreceptors covering the entire UV-to-visible spectrum. Curr. Opin. Struct. Biol. 2019 Aug;57:39-46.
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